本作以星际旅行的科幻背景，讲述能够使用「以太齿轮」操纵重力的少年「四季」、没什么人气的实况主「蕾贝卡」，以及机械蓝猫「哈比」。他们将乘坐战列舰「EDNES ZERO」四处冒险，寻找能够实现一切愿望的神秘生命体「MOTHER」。

女大学生丽乃（井口裕香 配音）是一个嗜书如命的女孩，在经过了不懈的努力，千辛万苦终于得到了图书管理员这个职位后，丽乃在第一天上班的时候就遭遇了地震，导致她被书活埋。当丽乃再度恢复意识的时候，发现自己转生，以5岁女孩梅茵的身份来到了异世界中。  　　让丽乃无法接受的是，这个世界里既没有书店，也没有图书馆，所有可供翻阅的书籍都标记着天价仅供有钱人消遣，作为穷人家的女儿，梅茵这辈子也许都不能够摸到书本。凭借着对书籍的满腔热情，丽乃决定不甘于现状，既然无法买到书，那么就来制作书吧！很快，丽乃的决定就吸引来了志同道合的伙伴们。

2050年。由于在父亲创立的制造公司·Rebuild社对“自律机械DZ”的开发做出了贡献，  　　因而年纪轻轻就赢得了名声的技术人员德里达·伊万（主人公）。  　　有一次，德里达与同僚内桑注意到了“DZ”的重大缺陷，  　　但上司却完全不听从忠告，对此感到恼火的他在知道危险的情况下仍然拖延应对，  　　并前去参加内桑的爱女·玛吉的生日派对。  　　但，在度过了一时平稳之后的第二天，德里达和内桑遭到神秘部队的袭击。  　　在出逃的最后，落入冷冻睡眠装置的德里达再次睁开眼时，  　　时间已经过了10年，放眼望去的世界早已荒废，陷入了战争状态！  　　就在遭到失控的“DZ”群的袭击，即将放弃一切的时候，  　　德里达回想起了内桑临终的话语。  　　“玛吉就拜托你了”  　　即使对降临到自己身上的命运感到困惑，但为了寻找玛吉，德里达仍然向前迈进。  　　重逢，超越了“时间”——  　　这是，思念踏上旅途的故事。

2050年。由于在父亲创立的制造公司·Rebuild社对“自律机械DZ”的开发做出了贡献，  　　因而年纪轻轻就赢得了名声的技术人员德里达·伊万（主人公）。  　　有一次，德里达与同僚内桑注意到了“DZ”的重大缺陷，  　　但上司却完全不听从忠告，对此感到恼火的他在知道危险的情况下仍然拖延应对，  　　并前去参加内桑的爱女·玛吉的生日派对。  　　但，在度过了一时平稳之后的第二天，德里达和内桑遭到神秘部队的袭击。  　　在出逃的最后，落入冷冻睡眠装置的德里达再次睁开眼时，  　　时间已经过了10年，放眼望去的世界早已荒废，陷入了战争状态！  　　就在遭到失控的“DZ”群的袭击，即将放弃一切的时候，  　　德里达回想起了内桑临终的话语。  　　“玛吉就拜托你了”  　　即使对降临到自己身上的命运感到困惑，但为了寻找玛吉，德里达仍然向前迈进。  　　重逢，超越了“时间”——  　　这是，思念踏上旅途的故事。

主要讲述了喜欢魔术的高中生黑羽快斗，在自己房间内一道隐藏的门后的密室里发现了世界闻名的大盗怪盗基德的服装。之后，身着怪盗基德服装的快斗遇见了父亲——世界知名的魔术家黑羽盗一以前的助手寺井黄之助，从他的口中得知自己的父亲正是怪盗基德，而且他并非死于意外，而是被人暗杀。为了找出杀害父亲的人，快斗决定以第二代怪盗基德的身份开始着手调查父亲真正死因。在以怪盗基德的身份活动的某日，快斗与称呼自己为“黑羽盗一”的神秘组织相遇，而该组织正是他的杀父仇人，故事也由此正式拉开帷幕。